Seit Dezember 2019 ist Michael Hager Kabinettschef des Exekutiv-Vizepräsidenten V. Dombrovskis, zuständig für "Eine Wirtschaft, die den Menschen dient" und Kommissar für Handel.
Von März 2013 bis November 2019 war er Kabinettschef von Günther H. Oettinger, zuletzt EU-Kommissar für Haushalt und Personal sowie zuvor für Digitale Wirtschaft und Gesellschaft und Energie, und zuvor seit 2010 Mitglied von Oettingers Kabinett.
Von 2008 bis 2010 war er Mitglied des Kabinetts von Margot Wallström, Vizepräsidentin der Europäischen Kommission und zuständig für institutionelle Beziehungen und Kommunikation. Er kam 2004 zur Europäischen Kommission und war zunächst Koordinator für parlamentarische Angelegenheiten in der Generaldirektion Binnenmarkt, später Assistent des Generaldirektors.
Bevor er zur Europäischen Kommission kam, arbeitete er von 1999 bis 2004 als Assistent der Europaabgeordneten Brigitte Langenhagen. Michael Hager hat einen Magisterabschluss in Geschichte, Politik und Japanologie von der Eberhard-Karls-Universität Tübingen.